Das die Platte unter Windows booten konnte heißt noch lange nicht das sie das auch unter Linux kann. Es gibt Treiber die man auf der Platte installieren kann, damit Windows auch auf Sektoren oberhalb der Grenzen des BIOS zugreifen kann, jene Treiber mag jedoch Linux nicht.
ODER
ganz einfach immer von Diskette booten.
Alle Angaben ohne Gewähr: Ich bin absoluter Linux- Neuling, irgendwo hatte ich gelesen das es so geht, bei mir hat es so auf Anhieb funktioniert, ich habe eine Quantum-Bigfoot-HD mit 2,5GB in einem uralten 486'er der unter DOS nur an 520MB dran kam.
http://KarlKramer.de/tips/Linux/hd-booting.html ©1998 Karl Kramer